En 1986, México se adhirió a la Convención Ramsar, un tratado que se ocupa de la protección de humedales. En Jalisco existen 13 sitios Ramsar, ocho de ellos están en Costalegre.
Desde la laguna de Barra de Navidad hasta el estero Majahuas, se despliegan áreas protegidas que albergan una rica diversidad de ecosistemas y poblaciones extensas de aves, peces y crustáceos.
